微生物實驗室作為實驗室檢驗人的一個工作空間，其良好的自然通風(fēng)是絕對關(guān)鍵，必要時更應(yīng)配備抽風(fēng)機。接種、分離及鑒定細菌等操作應(yīng)在生物安全柜中進行，對結(jié)核桿菌等傳染性極強的微生物學(xué)檢驗時必須在100 ％外臨床微生物學(xué)實驗室接觸多種有害微生物，為了防止交叉污染，保護工作人員健康，實驗室應(yīng)至少劃分成3個區(qū)。

一、無菌區(qū)
（1）無菌室應(yīng)完全封閉，進出無菌室至少要經(jīng)兩道門，中間隔有緩沖間，無菌室與外間設(shè)置一個可開閉的窗口，用于傳遞器具。
（2）無菌室必須保持整潔。工作人員進入無菌室應(yīng)換專用鞋、專用衣。無菌室使用前須用紫外線消毒30 min ，操作結(jié)束后清潔臺面，再用紫外線消毒30 min 。定期用乳酸或甲醛熏蒸，徹底消毒。
（3）無菌室僅用于培養(yǎng)基分裝等無菌操作，不能進行有菌標本的操作。操作人員操作時應(yīng)嚴格關(guān)門，并戴好專用的口罩、帽子。
（4）無菌室內(nèi)應(yīng)有空氣過濾裝置，并安裝空調(diào)
二、清潔區(qū)
包括辦公室、休息室、培養(yǎng)基配制室與試劑儲藏室。此區(qū)域禁止帶人細菌檢驗標本。
三、操作區(qū)
（1）整潔：微生物操作區(qū)是各種病原菌相對集中的地方，為了減少粉塵流動，防止交叉污染，操作區(qū)應(yīng)與外界分開。實驗室工作人員進入操作區(qū)應(yīng)換鞋，送標本人員不進入操作區(qū)，操作區(qū)地面用專用拖

把每天拖1 次，每周用消毒劑擦洗1 次。每天早上工作前，用紫外線照射30 min ，或每天工作后，用紫外線照射60 min ，對整個操作區(qū)進行消毒；下午工作結(jié)束后用消毒液消毒工作臺面，以保證工作

環(huán)境的安全清潔。
（2）光線：細菌培養(yǎng)的細小菌落及血清試驗?zāi)w粒的觀察， 都需要有充足的光線。操作區(qū)除設(shè)置常規(guī)照明燈外，還必須安裝操作臺燈，以保證實驗結(jié)果的正確判斷。
（3） 通風(fēng)：由于各種病原菌集中，空氣污濁，實驗室要求保持排的生物安全柜中進行。
（4）溫度和濕度：由于無菌操作的要求，實驗過程中經(jīng)常使用酒精燈，因此，微生物學(xué)實驗室不能安裝吊扇。為了達到實驗所需的適宜溫度，尤其是滿足某些儀器對溫度濕度的要求，實驗室應(yīng)安裝空調(diào)

。
（5）電源：要求提供穩(wěn)壓、恒頻的電源；根據(jù)儀器設(shè)備要求，必要時配備不間斷電源。
（6）水源：操作區(qū)內(nèi)須設(shè)置水源。用于標本處理（如細菌染色） 的水槽與工作人員洗手用的水槽不能混用。
（7）污染物處理：操作區(qū)須備有消毒缸，以處理沾有活菌的玻片等污染物品。檢驗剩余的標本及使用過的帶菌平板、試管均須集中地點安全放置，經(jīng)消毒滅菌處理后再洗滌或丟棄。